大学院での学習は，学生の所属する専攻での高度な専門知識を体系的に修得することは勿論であるが，所属専攻だけにとどまらず，所属専攻以外の分野についての講義を履修し，複数の専門領域に関する学習を行うことは有意義であることと考える。
このため，下記に示す専攻に副専門制度が設けられており，副専門としようとする専攻において所定の単位を修得し，当該専攻の認定を得られれば，成績証明書に副専門とした専攻名と修得した授業科目名が付記される。
この副専門の履修を希望する者は，指導教員の承認を得た後，あらかじめ希望する副専門の専攻において，あらかじめ履修指導を受け，所定の単位を修得した場合は，履修様式第13号により，その専攻に願い出て認定を受けた後，教務課に届け出なければならない。
ただし，最終学期の受講をもって副専門制度の認定を受けようとする者は，３月修了予定者については，前年の10月の学習申告期，９月修了予定者については，４月の学習申告期に副専門認定願を教務課に届け出なければならない。
なお，所属専攻が指定科目としている授業科目は，副専門で修得しようとする授業科目には含めることができない。
また，大学院学習規定第９条第２項の規定により，修士課程の修了要件となる16単位以上の一部となった授業科目は，含めることができない。
※副専門科目として認定を受けた授業科目は，修了要件の30単位には原則として含まれない。ただし，「副専門認定願」提出時に所定の手続きにより，副専門科目を修了要件の他専攻科目として含めることができる。（副専門科目を他専攻科目として認定するか否かについては所属専攻の判断とする。）
材料工学専攻
金属材料分野もしくは無機材料分野のいずれかについて下記授業科目を履修すること。
金属材料分野（８単位）
(1) 金属材料分野の主専攻授業科目において，次の３分野から，各分野最低１科目ずつ履修すること。あらかじめ，材料工学専攻長と相談すること。
(1) 金属物理学分野：
回折結晶学
2－0－0
金属物性特論
2－0－0
(2) 金属化学分野：
金属移動論
2－0－0
酸化物の固体化学
2－0－0
固体熱力学特論
2－0－0
材料の環境劣化
2－0－0
融体の物理化学
2－0－0
(3) 金属材料学分野：
合金の相変態
2－0－0
高温強度学特論
2－0－0
金属のミクロ組織
2－0－0
金属材料学特論
2－0－0
無機材料分野（８単位）
(1) 次の授業科目から選択する。あらかじめ，材料工学専攻長と相談すること。
ナノバイオニクス特論
2－0－0
セラミックプロセッシング特論
2－0－0
誘電体・強誘電体特論
2－0－0
粉体の物理化学
2－0－0
高温構造材料特論
2－0－0
材料資源・原料特論
2－0－0
材料開発特論第一
2－0－0
材料開発特論第二
2－0－0
Quality and Reliability Engineering in Ceramics
2－0－0
材料機器分析特論
2－0－0
応用化学専攻（８単位）
(1) 次の授業科目から選択する。あらかじめ，応用化学専攻長と相談すること。
有機合成化学特論
2－0－0
有機反応・合成化学特論
2－0－0
有機分子設計特論
2－0－0
分子触媒化学特論
2－0－0
有機遷移金属錯体化学
2－0－0
固体物性化学特論
2－0－0
無機固体化学特論
2－0－0
無機反応特論
2－0－0
触媒反応特論
2－0－0
生物無機化学特論
2－0－0
電気化学特論
2－0－0
化学工学専攻（８単位）
(1) 次の授業科目から選択する。あらかじめ，化学工学専攻長と相談すること。
移動現象操作
2－0－0
反応工学特論
2－0－0
化工物性解析
2－0－0
エネルギー操作特論
2－0－0
分離操作特論
2－0－0
化学装置設計特論
2－0－0
プロセスシステム解析
2－0－0
触媒反応プロセス
2－0－0
化学工学要論第一
2－0－0
機械物理工学専攻，機械制御システム専攻，機械宇宙システム専攻（８単位）
(1) 次の４科目６単位と学習案内に記載されている熱・流体分野科目（下表参照）より２単位以上を含む８単位以上を取得すること。
構造力学特論
1－0－0
固体力学特論
1－0－0
システム制御特論
2－0－0
機械力学基礎
2－0－0
熱・流体分野科目
流体工学持論
2－0－0
ミクロ輸送学特論
2－0－0
エネルギー物理学特論
2－0－0
エネルギー工学特論
2－0－0
環境熱工学持論
2－0－0
数値熱流体力学特論
2－0－0
トライボロジー特論
2－0－0
流体物理学特論
2－0－0
Intensive Thermal Engineering
2－0－0
(2) 上記機械系３専攻のいずれを選択するかは自由である。あらかじめ希望する専攻の専攻長と相談すること。
(3) 機械系３専攻に所属する学生は，所属専攻外の機械系３専攻の副専門認定は受けられない。
(4) 情報環境学専攻（機械系）ならびにメカノマイクロ工学専攻に所属する学生は当専門の副専門の認定は受けられない。
電気電子工学専攻，電子物理工学専攻（８単位）
(1) 申請者は履修計画案を作成し専攻長に申し出ること。専攻長は履修計画案に従って適当な専攻の履修指導員を推薦する。申請者は履修指導員の指導のもとに学習を進めること。
(2) 履修計画案は，２専攻の科目中で同一分野に属する科目を統一的に選択するように立てることが好ましい。
集積システム専攻（８単位）
(1) 申請者は履修計画案を作成し専攻長に申し出ること。専攻長は履修計画案に従って適当な専攻の履修指導員を推薦する。申請者は履修指導員の指導のもとに学習を進めること。
(2) 履修計画案は，専攻内の科目中で同一分野に属する科目を統一的に選択するように立てることが好ましい。
土木工学専攻（８単位）
(1) 土木工学専攻以外の専攻に属する学生で、土木工学専攻開講口科目（土木工学専攻が推奨する他専攻科目は含まない）を８単位以上履修した場合，土木工学専攻の承認を経て，副専門を認定し，成績表に明記される。
(2) 副専門申請希望者は，専攻が指定する書式（専攻のホームページからdownload可）にて，履修を希望する学期の学習申告期間に土木工学専攻長に申し出て，履修指導を受けること。
(3) 所定の単位を修得した場合は，学習申告期間に履修様式第13号を土木工学専攻長に提出し，土木工学専攻の認定をうけること。
国際開発工学専攻（８単位）
(1) 次の表から，●印の科目を２単位以上，●印と◎印を合計して６単位以上含み，総計８単位以上を選択すること。履修開始前に国際開発工学専攻長と相談すること。
●国際開発プロジェクト特論
2－0－0
◎Environmental Engineering in International Development／国際環境工学
2－0－0
◎Principles of International Co-existence／国際共存
2－0－0
◎国際資源産業論
2－0－0
●International Development Projects － Case Method
0－2－0
◎Sustainable Development and Integrated Management Approach
1－1－0
◎Introduction to Economics for Engineers
2－0－0
◎Project Evaluation for Sustainable Infrastructure
2－0－0
◎国際実習演習Ａ
0－0－1
◎国際実習演習Ｂ
0－0－1
Advanced Geotechnical Engineering
2－0－0
Regional Atmospheric Environment
2－0－0
Durability and Maintenance of Construction Materials
2－0－0
Rural Telecommunications
1－0－0
Mathematical Science in Development Engineering
2－0－0
Basic theories for Information processing
2－0－0
Chemical Process System for Development
2－0－0
Welding and Joining Technology
2－0－0
Perspective Understanding of Various Kinds of Material
2－0－0
New Trends in Numerical Analysis
2－0－0
開発シミュレーション工学
2－0－0
原子核工学専攻（８単位）
(1) 次の授業科目から選択する。あらかじめ，専攻長と相談すること。
原子炉理論
2－1－0
原子炉設計工学
2－0－0
原子核反応・放射線
2－0－0
原子力安全工学
2－0－0
地球環境とエネルギーシステム
2－0－0
原子力システム工学
2－0－0
核・放射化学
2－0－0
燃料サイクル工学
2－0－0
核燃料・材料工学
2－0－0
プラズマ工学基礎
2－0－0
分子生命科学専攻（８単位）
(1) 次の授業科目から選択する。
生体分子機能論
2－0－0
構造解析学特論
2－0－0
生体分子認識論
2－0－0
分子遺伝生化学特論
2－0－0
(2) 生体システム，生命情報，生物プロセス及び生体分子機能工学専攻に所属する学生は，当専攻の副専門の認定は受けられない。
生体システム専攻（８単位）
(1) 当専攻の授業科目から選択する。選択科目が同一講座の科目に偏らないよう，あらかじめ専攻長と相談すること。
(2) 分子生命科学，生命情報，生物プロセス及び生体分子機能工学専攻に所属する学生は，当専攻の副専門の認定は受けられない。
生命情報専攻（８単位）
(1) 生命理工学研究科５専攻共通科目・特別講義・実験・講究を除く，生命情報専攻教員が担当する科目の中から選択する。
(2) 分子生命科学，生体システム，生物プロセス及び生体分子機能工学専攻に所属する学生は，当専攻の副専門の認定は受けられない。
生物プロセス専攻（８単位）
(1) 次の授業科目から選択する。
生物化学プロセス特論
2－0－0
生物機能工学特論
2－0－0
生物化学工学特論
2－0－0
分子生物工学特論
2－0－0
細胞工学特論
2－0－0
(2) 分子生命科学，生体システム，生命情報及び生体分子機能工学専攻に所属する学生は，当専攻の副専門の認定は受けられない。
生体分子機能工学専攻（８単位）
(1) 生命理工学研究科５専攻共通開講科目・特別講義・実験・講究を除く，生体分子機能工学専攻教員が担当する科目の中から選択する。
(2) 分子生命科学，生体システム，生命情報及び生物プロセス専攻に所属する学生は，当専攻の副専門の認定は受けられない。
創造エネルギー専攻（８単位）
(1) 次の３つの授業科目とその他の当専攻開講授業科目より２単位を取得すること。
エネルギー環境基礎論
2－0－0
エネルギー変換基礎論
2－0－0
エネルギー創造基礎論
2－0－0
(2) あらかじめ専攻長と相談し，履習指導を受けること。
化学環境学専攻（８単位）
(1) 各研究科共通科目，当専攻必須科目（○を付したもの）を除く専攻の授業科目から選択する。
メカノマイクロ工学専攻（８単位以上）
(1) 次の授業科目から選択する。ただし，メカノマイクロ工学基礎学第一，同第二の取得を必須とする。
なお，機械系の専攻に所属する学生は当専攻の副専門の認定は受けられない。
メカノマイクロ工学基礎学第一
3－0－0
同 第二
3－0－0
同 第三
3－0－0
超精密オプトメカトロニクス
2－0－0
Theory of Robotics
2－0－0
アクチュエータ工学特論
2－0－0
Advanced Mechanical Systems Design
2－0－0
Advanced Neural Network Systems
2－0－0
振動・音響計測特論
2－0－0
Process Measurement and Control
2－0－0
工作機械工学特論
2－0－0
微細加工・応用特論
2－0－0
極限機械システム特論
2－0－0
知能システム科学専攻（８単位以上）
(1) 特別講義・講究等を除く専攻の授業科目のうちから８単位以上を選択する。
計算工学専攻（10単位）
申請者は前もって履修計画案を作成し専攻長に申し出ること。
(1) 基盤的科目より８単位，先端的科目より２単位を取得すること。
(2) ４つの専門分野から必ず１授業科目は取得すること。
(3) 所属専攻の推奨科目は，副専門の履修科目としては認めない。
情報環境学専攻（８単位）
(1) 次の授業科目から選択する。
計測・情報学特論
2－0－0
ダイナミカルシステム特論
2－0－0
計測情報の数理処理
2－0－0
Advanced Course of Inverse Problems
1－0－0
オブジェクト指向設計法
1－1－0
Linear Systems and Control
1－0－0
Nonlinear and Adaptive Control
1－0－0
広領域知識ベース特論
2－0－0
情報地域計画特論
2－0－0
振動・波動解析特論
2－0－0
Econometric Analysis
2－0－0
情報都市空間特論
2－0－0
環境数値シミュレーション１
2－0－0
環境数値シミュレーション２
2－0－0
環境モニタリングと情報化１
2－0－0
環境モニタリングと情報化２
2－0－0
人間行動システム専攻（８単位）
(1) 申請者は履修計画案（申請理由を含む）を作成し，あらかじめ専攻長と相談し履修指導を受けること。
(2) 専攻の必須科目，実験，特別実験，講究を除く専攻の授業科目から選択すること。
(3) 演習の授業は２単位まで含めることができる。
(4) 受講科目を副専門と特別教育研究コースとに重複利用することは認めない。
価値システム専攻（８単位）
(1) あらかじめ，自身の指導教員の承認を得た後，本専攻の専攻長から履修指導を受けること。
(2) 研究科共通科目及び価値システム討議・実験（ディスカッション・プログラム）を除く専攻の授業科目から選択すること。
(3) ただし，価値システム特別演習については２単位までとする。
(4) 所定の単位を取得したときに，本専攻長に申し出て，決められた申請手続をとること。
経営工学専攻（８単位）
(1) 演習，実験，講究を除く経営工学専攻の授業科目および先端経営システム工学（経営システム工学科授業科目）から選択すること。
(2) 副専門科目として認定を受けた授業科目は自専攻の修了要件の30単位には含めてはならない。
(3) あらかじめ専攻長と相談し履修指導を受けること。
技術経営専攻（10単位）
技術経営分野の副専門申請希望者は前もって，技術経営専攻長に相談し，受講計画を提出すること。経営工学専攻に所属する学生は当専攻の副専門の認定は受けられない。
(1) 次の授業科目から６単位選択する。
技術経営概論
2－0－0
技術戦略論
2－0－0
技術組織論
2－0－0
イノベーション論
2－0－0
Ｒ＆Ｄ戦略
2－0－0
イノベーションと産官学連携
2－0－0
先端技術とイノベーション
2－0－0
イノベーションと標準化
2－0－0
企業戦略とイノベーション
2－0－0
金融工学
2－0－0
金融リスクマネジメント
2－0－0
コーポレートファイナンス
2－0－0
組織戦略とICT
2－0－0
テレワーク概論
2－0－0
IPマネジメント
2－0－0
実践知的財産保護
1－1－0
知的財産権法
2－0－0
(2) 上記以外の本専攻開講科目から４単位選択する。ただし，講究・インターンシップ科目および次の科目は選択できない。
リサーチ・リテラシーの演習
1－1－0
戦略的ディベートの実践
0－1－0